Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF6Q9BYE7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms