Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms