Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5Q99717 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms