Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAT1Q99536 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms