Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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