Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms