Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGM2L1Q6PCE3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms