Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms