Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms