Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms