Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GEN1Q17RS7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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