Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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