Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NRF1Q16656 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms