Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYPL1Q16563 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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