Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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