Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAPTM4AQ15012 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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