Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms