Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NAE1Q13564 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NAE1Q13564 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NAE1Q13564 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NAE1Q13564 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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