Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SGCGQ13326 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCGQ13326 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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