Protein–RNA interactions for Protein: Q12882

DPYD, Dihydropyrimidine dehydrogenase [NADP(+)], humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYDQ12882 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPYDQ12882 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms