Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms