Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ID3Q02535 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ID3Q02535 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms