Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms