Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TMEM258P61165 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms