Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms