Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HCCSP53701 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HCCSP53701 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms