Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms