Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NESP48681 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NESP48681 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NESP48681 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NESP48681 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NESP48681 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms