Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms