Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFNP31947 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFNP31947 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFNP31947 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFNP31947 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFNP31947 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFNP31947 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms