Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms