Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms