Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms