Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms