Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP9BO43861 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms