Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms