Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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NDUFS4O43181 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFS4O43181 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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