Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms