Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms