Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms