Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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