Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEMP2A6NFY4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms