Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms