Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SETBP1Q9Y6X0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SETBP1Q9Y6X0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SETBP1Q9Y6X0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms