Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P6

GMPPB, Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPBQ9Y5P6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMPPBQ9Y5P6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMPPBQ9Y5P6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMPPBQ9Y5P6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms