Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB3Q9Y5G1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGB3Q9Y5G1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB3Q9Y5G1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms