Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4S1Q9Y587 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms