Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF1Q9Y548 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF1Q9Y548 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF1Q9Y548 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms