Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC46.14■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
DCAF1Q9Y4B6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC46.11■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC46.08■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
DCAF1Q9Y4B6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
DCAF1Q9Y4B6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC45.94■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC45.94■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
DCAF1Q9Y4B6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC45.9■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC45.88■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
DCAF1Q9Y4B6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC45.87■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC45.84■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms