Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRELID3BQ9Y3B1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRELID3BQ9Y3B1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms